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Algunas especies son exclusivas de un lugar, área o región geográfica concreta, y no se encuentran en ninguna otra parte del mundo. Reciben el nombre de endemismos y, por su rareza, merecen una atención especial en las políticas de conservación.

El territorio español cuenta con unas 20.000 especies de hongos, líquenes y musgos, y entre 8.000 y 9.000 especies de plantas vasculares (helechos y plantas con flores). Esta última cifra representa el 80% de las existentes en la Unión Europea, y casi el 60% de las que se hallan en todo el continente. De todas estas plantas, más de 6.500 son autóctonas, incluyendo unos 1.500 endemismos únicos en el mundo, y otros 500 compartidos con el Norte de África.

En cuanto a la fauna, la Península Ibérica posee la mayor riqueza de Europa occidental, entre 50.00 y 60.000 especies animales, lo que equivale a más del 50% de las existentes en la Unión Europea.

Tal como se puede observar en el mapa, la distribución de los endemismos es muy desigual. Las regiones más ricas son las insulares, y en particular las Islas Canarias, así como algunas áreas de montaña, lugares en los que se supera la cifra de 50 endemismos por 1.000 km².