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En España, donde la biodiversidad es muy importante, existen numerosos espacios naturales protegidos. El número y la superficie protegida han aumentado considerablemente en los últimos años, gracias a la iniciativa de las diferentes comunidades autónomas. Además, la Unión Europea ha creado la Red Natura 2000, que tiene el objetivo de armonizar las políticas y criterios de protección de la naturaleza a escala comunitaria. En ella existen dos tipos de áreas: las ZEPA ("zonas de especial protección para las aves") y los LIC ("lugares de importancia comunitaria"). Todas estas iniciativas pretenden garantizar la pervivencia, o el restablecimiento de los hábitats naturales, y de los entornos de los que dependen las especies amenazadas.

La mayor parte de los espacios españoles integrados en la Red Natura 2000 coinciden, en líneas generales, con las áreas de montaña, las zonas húmedas, algunos sectores del litoral, y con amplias zonas de los dos archipiélagos: Baleares y Canarias. Es decir, ámbitos territoriales donde las transformaciones humanas han sido menos intensas y, por ello, se ha conservado una mayor proporción de sus ecosistemas.